SCImago Institutions Ranking (SIR) เป็น การจัดอันดับสถาบันที่มีผลงานวิจัยในระดับนานาชาติ ซึ่งจะไม่ได้นับเฉพาะมหาวิทยาลัย แต่จะนับรวมสถาบันเฉพาะทางด้วย เช่น สถาบันเทคโนโลยี วิทยาลัย โรงพยาบาล สถาบันวิจัย เป็นต้น ซึ่งเป็นการจัดอันดับมหาวิทยาลัยรวมทั้งสถาบันวิจัยในแง่ของความสามารถในการเผยแพร่ผลงานวิชาการทุกประเภทของสถาบัน หรือมหาวิทยาลัยบนฐานข้อมูล Scopus
| อันดับปี 2012 | มหาวิทยาลัย | อันดับปี 2011 |
|---|---|---|
| 522 | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย | 564 |
| 532 | มหาวิทยาลัยมหิดล | 571 |
| 609 | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี | 626 |
| 624 | สถาบันเทคโนโลยีแห่งเอเชีย | 620 |
| 626 | มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ | 656 |
| 638 | มหาวิทยาลัยนเรศวร | 658 |
| 644 | มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ | 682 |
| 651 | มหาวิทยาลัยศิลปากร | 666 |
| 652 | มหาวิทยาลัยขอนแก่น | 693 |
| 653 | มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ | 693 |
| 670 | มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ | 696 |
| 672 | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี | 693 |
| 676 | สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง | 705 |
| 680 | มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ | 698 |
| 727 | มหาวิทยาลัยมหาสารคาม | 785 |