SCImago Institutions Ranking (SIR) เป็น การจัดอันดับสถาบันที่มีผลงานวิจัยในระดับนานาชาติ ซึ่งจะไม่ได้นับเฉพาะมหาวิทยาลัย แต่จะนับรวมสถาบันเฉพาะทางด้วย เช่น สถาบันเทคโนโลยี วิทยาลัย โรงพยาบาล สถาบันวิจัย เป็นต้น ซึ่งเป็นการจัดอันดับมหาวิทยาลัยรวมทั้งสถาบันวิจัยในแง่ของความสามารถในการเผยแพร่ผลงานวิชาการทุกประเภทของสถาบัน หรือมหาวิทยาลัยบนฐานข้อมูล Scopus
| อันดับปี 2016 | มหาวิทยาลัย | อันดับปี 2015 |
|---|---|---|
| 450 | มหาวิทยาลัยมหิดล | 463 |
| 475 | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย | 481 |
| 538 | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี | 533 |
| 547 | มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ | 551 |
| 552 | มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ | 553 |
| 560 | มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ | 572 |
| 574 | มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง | 589 |
| 582 | มหาวิทยาลัยขอนแก่น | 589 |
| 610 | สถาบันเทคโนโลยีแห่งเอเชีย | 593 |
| 617 | มหาวิทยาลัยศิลปากร | 606 |
| 620 | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี | 601 |
| 629 | มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ | 608 |
| 632 | มหาวิทยาลัยมหาสารคาม | 648 |
| 634 | มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ | 596 |
| 636 | สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง | 614 |
| 645 | มหาวิทยาลัยนเรศวร | 631 |
| 677 | มหาวิทยาลัยรังสิต | 670 |